Dissensions entre Réformés et Catholiques à la Réforme

Si la Réformation avait été imposée sans trop de peine en pays conquis, elle fut bien moins facile à propager dans les bailliages d’Orbe, de Grandson, d’Echallens qui appartenaient à Berne et à Fribourg. De querelles fréquentes entre catholiques et protestants menaçaient sans cesse la tranquillité de ces villes.

Quoique Berne et Fribourg alternassent pour nommer les baillis par période de cinq années, la paix était rare. On décida alors de faire voter le peuple et d’accepter l’un des deux cultes à la majorité des suffrages. C’est ce qu’on appela faire le « plus« . Enfin, en 1558, La Réforme fut définitivement établie à Orbe et à Grandson.

Bailliage d’Echallens

Dans ce bailliage, où les partisans du catholicisme étaient en majorité, Berne ne parvint pas à supprimer la messe et les deux cultes qui y vécurent côté à côté.
La vie religieuse, d’ailleurs, n’avait rien de très édifiant et les gens ne prenaient gère plaisir  au culte imposé. Pierre Viret, pour remédier à l’indifférence songea à imposer la discipline ultra sévère que Calvin venait d’inaugurer à Genève et qui, sous le nom de Discipline ecclésiastique était devenue la loi suprême de la République. Mais Berne n’entendait pas que l’Eglise se substitue à son autorité ; elle s’opposa au projet de Viret. Les ministres durent se soumettre ou partir dont Viret qui se retira à Genève puis à Lyon. Il mourut à l’âge de soixante ans (1571).
Berne venait ainsi d’affirmer sa volonté de régner en tout et sur tout. Dès lors, – sauf à l’occasion du Consensus – les ministres comprirent le rôle que leur imposait LL. EE. et ils obéirent aveuglément.

Cependant, la paix religieuse ne débuta qu’en 1556. Alors, la soumission était absolue, les pasteurs ne réclamaient jamais, même lorsque LL. EE. décidèrent de ne convoquer les classes qu’une seule fois par année et sous la présidence d’un bailli bernois. Berne qui avait donné une règle de doctrine à l’Eglise en imposant le catéchisme d’Heidelberg, adopta la confession de foi helvétique, rédigée par le ministre Bulliger de Zurich.

« Les Deux Cents de Berne devinrent ainsi le chef suprême de l’Eglise protestante, d’où son despotisme bannit le libre examen ».

Dépourvu de ressources pécuniaires, sans armée,  Emanuel-Philibert de la Maison de Savoie entrepris des négociations avec Berne et Fribourg pour traiter la restitution des terres du Pays de Vaud, du Chablais et de Gex et de tous le territoire en deçà et au-delà du lac. Les négociations durèrent de 1560 à 1564 sans résultat et le duc eut peur d’une guerre avec Berne. Il s’adressa au roi d’Espagne et avec l’aide de celui-ci, un traité fut signé le 30 octobre 1564. « Les seigneurs de Berne gardèrent toute la propriété du Pays de Vaud, la Seigneurie et le bailliage de Nyon, de même que Vevey, la Tour-de-Peilz, Villeneuve. » La France et l’Espagne garantirent ce traité.
La conquête était maintenant régularisée par la diplomatie et le Pays de Vaud se pouvait croire pour toujours sous la domination de Berne.

 Il fallait maintenant organiser le pays, tout en lui garantissant – pour la forme – ses privilèges et franchises. Mais de prime abord LL. EE. voulurent payer l’indemnité à accordée à la Savoie par le traité de Lausanne et elles résolurent de la faire payer par le pays conquis! Berne convoqua alors les Etats de Vaud à Payerne au printemps de 1570 pour décider le payement d’une indemnité de trente mille écus d’or avec la réserve, toute platonique, que LL. EE. de Berne n’en tireraient aucune conséquence, ni préjudice, contre les libertés, franchises, exemptions et immunités pour l’avenir.
Berne ayant demandé au préalable la communication de ces libertés et franchises, par un juriconsulte vaudois, Pierre Quisard, seigneur de Crans, qui se mit à l’oeuvre. Ce projet fut accepté par huit villes du Pays qui envoyèrent leurs députés le présenter aux conseils de Berne. Les Deux Cents confirma ces Coutumes et Libertés. Elles furent promulguées le 12 mai 1577 sous le nom de Loi écrite.